Fylkesmannen skyldte på press og at Nye Veier AS ikke hadde tid til å vente på forundersøkelser på Hellstranda før de starter dumping av fyllmasse i sjøen. Nå har Fylkesmannen erklært seg inhabil.
Ulovlig fiske bekymrer i forhold til at tallet på gytefisk i elva blir redusert og kan også føre til at det lovlige fisket må reguleres strengere for å nå forvaltningsmålet for elva. Styret oppfordrer grunneiere og andre å rapportere mistanke om ulovlig fiske i Skauga.
I 2015 ble det etablert en smoltrenne forbi Turbinen i Svanedal kraftstasjon. Renna går fra Ikraftstasjonens inntaksdam og har sitt utløp til elva nedenfor kraftstasjonen.
Substrat som ikke er naturtypisk for en elvestrekning kan føre til vesentlige endringer i biologisk mangfold og produksjon. Skyldes ofte utslipp av finsediment, f.eks. fra sandtak og anleggsvirksomhet m.m.
Utlegging av sediment brukes for å kompensere for kunstig redusert sedimenttransport som kan forårsakes av demninger og erosjonssikring.
Harving, ripping og spyling av substratet utføres for å fjerne finsedimenter og løse opp bunnsubstrat, slik at mengden skjul og hulromsvolum for fisk og bunndyr øker.
Brukes på strekninger der det er mangel på skjul og morfologisk variasjon eller der stein har blitt fjernet.
Før, under og etter sesongen kreves det en del vedlikehold langs elva. Alta Laksefiskeri Interessentskap (ALI) minner på at alle som ferdes langs elva har et ansvar for å rydde opp etter seg.