Gyrodactylus salaris sammen med lakeslus og rømt oppdrettslaks er de største truslene mot de ville laksestammene. Etter nesten 35 år med gyrosmitte i vassdraget ble endelig elva rotenonbehandlet i 2003 og 2004.
Nærøydalsvassdraget elveeigarlag, seinare kalla laget, er ei samanslutting av grunneigarar med fiskerett i Nærøydalselva, Jordalselva, Sivleelva og Stalheimselva.